Арктический государственный институт культуры и  искусств был создан 17 января 2000 года по инициативе первого Президента Республики Саха (Якутия) Михаила Ефимовича Николаева и министра культуры и духовного развития Якутии, первого ректора-организатора института Андрея Саввича Борисова для сохранения и развития духовной культуры народов Арктики.

Идея объединения якутских филиалов федеральных вузов культуры и искусства - Красноярского государственного художественного института, Уральской государственной консерватории им. М.П. Мусоргского, Школы-студии им. В.И. Немировича-Данченко при МХАТ им. А.П. Чехова, Восточно-Сибирской государственной академии культуры и искусств — оказалась значимой для развития духовного и культурного потенциала региона Арктики.

Неоценимый вклад в становление института внесли профессора головных вузов, видные деятели искусства и культуры – певцы Н.Н. Голышев и С.В. Зализняк, домрист Ш.С. Амиров (Уральская консерватория), мастера сцены Е.В. Радомысленский и В.Н. Комратов (Школа-студия МХАТ), живописцы А.А. Покровский, В.Н. Бычинский (Красноярский художественный институт), музыковед М.М. Берлянчик (Магнитогорская консерватория), профессора ВСГАКИ Р.И. Пшеничникова, С.А. Езова и многие другие.

В 2006 г. институт был передан в федеральное ведение, и он пополнил плеяду вузов культуры и искусства, входящих в систему художественного образования и курируемых Министерством культуры Российской Федерации.

В 2007 году в соответствии с распоряжением Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки институт впервые прошел комплексную оценку деятельности, и в начале 2008 года Рособрнадзор принял решение об аккредитации АГИИК.

В банке данных Росаккредагентства из 45 вузов культуры и искусств России АГИКИ занял почетное 20-е место.