В АГИИК воинский учет осуществляется сотрудниками  отдела кадров на основании Постановления Правительства Российской Федерации от 27 ноября 2006 г. № 719 «Положение о воинском учете» граждане, зачисленные на очную форму обучения, обязаны:

•    в двухнедельный срок встать на воинский учет;
•    сообщать об изменении сведений о семейном положении, образовании, состоянии здоровья, месте жительства, паспортных данных;
•    являться в установленное время и дату Военный комиссариат г. Якутска по вызову, имея при себе паспорт гражданина Российской Федерации, военный билет или удостоверение гражданина, подлежащего призыву на военную службу.

Студенты очной формы обучения обязаны ежегодно в сентябре месяце получать справку формы № 26, подтверждающий факт получения образования по очной форме обучения и представить в  военный комиссариат г. Якутска не позднее 01 октября. Ежегодно, на основании данного документа, призывная комиссия военного комиссариата принимает решение о предоставлении отсрочки от призыва в Вооруженные Силы и доводит решение до призывника.